Важным направлением работы Брюховецкого историко-краеведческого музея является научно-исследовательская деятельность.
Ежегодное изучение архивных документов и исторических материалов открывает имена жителей станицы, участников исторических событий более чем вековой давности. С начала 2019 года сотрудники музея, работают по православной теме. Итогом этой работы должна стать научно-исследовательская статья об истории православных храмов станицы Брюховецкой. Есть основания утверждать, что ко дню Светлой Пасхи с историей брюховецких церквей познакомятся посетители сайта музея.